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生命學(xué)院陳春來(lái)課題組合作揭示配體效能調(diào)控μ型阿片受體構(gòu)象動(dòng)態(tài)變化的分子機(jī)制

清華新聞網(wǎng)4月19日電 在臨床治療領(lǐng)域,嗎啡和芬太尼等阿片類(lèi)藥物是目前臨床上最常用的強(qiáng)效鎮(zhèn)痛藥,它們通過(guò)激活腦內(nèi)的μ型阿片受體(μO(píng)R)產(chǎn)生鎮(zhèn)痛效果。然而,阿片類(lèi)藥物的長(zhǎng)期使用可能導(dǎo)致依賴(lài)性、耐受性增加以及嚴(yán)重的副作用,如便秘和致死的呼吸抑制。因此,解析μO(píng)R的激活機(jī)制及其與不同藥物的相互作用對(duì)開(kāi)發(fā)新型鎮(zhèn)痛藥物具有重要的理論和實(shí)際意義。

4月10日,清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院陳春來(lái)課題組與斯坦福大學(xué)布賴(lài)恩·科比爾卡(Brian Kobilka課題組、加州大學(xué)洛杉磯分校韋恩·哈貝爾(Wayne Hubbell課題組合作,以“配體效能調(diào)控μ型阿片受體的構(gòu)象動(dòng)態(tài)”(Ligand efficacy modulates conformational dynamics of the μ-opioid receptor)為題,在《自然》(Nature)上發(fā)文。通過(guò)采用先進(jìn)的雙電子-電子共振(DEER)和單分子熒光共振能量轉(zhuǎn)移(smFRET)技術(shù),揭示了μO(píng)R在不同配體和胞內(nèi)下游信號(hào)蛋白作用下的重要亞穩(wěn)態(tài)構(gòu)象和構(gòu)象之間的動(dòng)態(tài)變化。研究發(fā)現(xiàn),配體通過(guò)調(diào)節(jié)μO(píng)R在不同亞穩(wěn)態(tài)構(gòu)象之間的動(dòng)態(tài)平衡,進(jìn)而影響受體對(duì)細(xì)胞內(nèi)信號(hào)分子的激活能力,即內(nèi)在效能。

μO(píng)R屬于G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)家族,這是一類(lèi)廣泛存在于細(xì)胞表面,通過(guò)接收外部信號(hào)并啟動(dòng)細(xì)胞內(nèi)響應(yīng)的膜蛋白。GPCR家族的成員參與了多種生命過(guò)程,從視覺(jué)和嗅覺(jué)到神經(jīng)傳遞和細(xì)胞內(nèi)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),因而成為了眾多藥物開(kāi)發(fā)的靶點(diǎn)。從科比爾卡課題組2007年發(fā)表第一個(gè)非視紫紅質(zhì)的GPCR(β2AR)結(jié)構(gòu)以及2011年發(fā)表第一個(gè)GPCR-G蛋白復(fù)合物結(jié)構(gòu)至今,不斷涌現(xiàn)的GPCR與配體以及胞內(nèi)信號(hào)蛋白的高分辨率結(jié)構(gòu)極大增強(qiáng)了科學(xué)人員對(duì)GPCR結(jié)構(gòu)和功能的理解。作為一類(lèi)復(fù)雜的、高度動(dòng)態(tài)的別構(gòu)調(diào)控膜蛋白,GPCR在配體作用下可在不同構(gòu)象之間變化,進(jìn)而激活下游的G蛋白或者招募β-arrestin(圖1)。然而,X射線(xiàn)晶體學(xué)和冷凍電鏡(Cryo-EM)等結(jié)構(gòu)生物學(xué)方法只能捕獲GPCR最穩(wěn)定的構(gòu)象。那些可能決定了GPCR功能的中間態(tài)構(gòu)象或者低比例的構(gòu)象卻難以被捕捉。相比之下,DEER技術(shù)能在亞埃級(jí)分辨率下獲得蛋白的不同構(gòu)象及其比例,而smFRET技術(shù)能夠?qū)崟r(shí)地獲得蛋白構(gòu)象動(dòng)態(tài)變化的信息。因此,這兩項(xiàng)技術(shù)在空間解析和時(shí)間解析方面相互補(bǔ)充,有效地揭示了μO(píng)R與配體相互作用以及激活下游信號(hào)蛋白的分子機(jī)制。

圖1.μ型阿片受體(μO(píng)R)與下游信號(hào)

研究人員首先使用一種新型的硝基氧自由基標(biāo)記物來(lái)標(biāo)記μO(píng)R的第四和第六跨膜螺旋(TM4和TM6)的胞內(nèi)端。通過(guò)DEER技術(shù),研究人員獲得了μO(píng)R在嗎啡等九種不同配體以及胞內(nèi)信號(hào)蛋白G蛋白或者β-arrestin存在時(shí)的構(gòu)象分布(圖2)。結(jié)果顯示,μO(píng)R存在四種不同的構(gòu)象,其中兩種構(gòu)象為抑制狀態(tài)(命名為R1和R2),兩種構(gòu)象為激活狀態(tài)(R3和R4)。然而,以往的晶體學(xué)和冷凍電鏡研究只揭示了一種抑制狀態(tài)和一種激活狀態(tài)的構(gòu)象。通過(guò)對(duì)比不同條件下μO(píng)R的構(gòu)象分布,研究人員發(fā)現(xiàn),與低效能(low efficacy)配體(如TRV130)相比,高效能(high efficacy)配體(如lofentanil)在沒(méi)有下游G蛋白結(jié)合時(shí),就能夠明顯增加μO(píng)R在激活狀態(tài)的比例。但是當(dāng)有G蛋白存在時(shí),不同效能的配體均能穩(wěn)定μO(píng)R的R3和R4激活狀態(tài)構(gòu)象,以R3構(gòu)象為主。這表明配體的效能與其單獨(dú)存在時(shí)穩(wěn)定激活狀態(tài)構(gòu)象的能力相關(guān)。與G蛋白相比,β-arrestin結(jié)合μO(píng)R的能力較差,且主要結(jié)合μO(píng)R的R4構(gòu)象,這一方面說(shuō)明μO(píng)R可能以不同的構(gòu)象結(jié)合G蛋白和β-arrestin,另一方面展示了高效能的配體能更強(qiáng)地招募β-arrestin的原因是其能夠增加R4狀態(tài)的比例。

圖2.雙電子-電子共振(DEER)揭示的μO(píng)R的構(gòu)象變化

圖3.smFRET實(shí)驗(yàn)揭示的μO(píng)R的構(gòu)象分布

不同效能的配體如何通過(guò)調(diào)控μO(píng)R的構(gòu)象變化來(lái)影響下游G蛋白信號(hào)的呢?研究人員使用熒光分子標(biāo)記μO(píng)R的TM4和TM6,并且使用smFRET技術(shù)觀(guān)測(cè)μO(píng)R在不同配體和G蛋白、GDP存在時(shí)的構(gòu)象分布及變化速率(圖3和圖4)。與DEER的結(jié)果相一致,smFRET實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,μO(píng)R在低效能配體存在時(shí)更傾向于抑制狀態(tài),而在高效能配體存在時(shí)更傾向于激活狀態(tài)。當(dāng)研究人員標(biāo)記μO(píng)R的第二個(gè)胞內(nèi)環(huán)圈(ICL2)而不是TM4時(shí),smFRET觀(guān)測(cè)到了拮抗劑或者低效能配體結(jié)合的μO(píng)R存在兩個(gè)狀態(tài),其構(gòu)象變化可能與配體的低效能相關(guān)。研究人員進(jìn)一步實(shí)時(shí)觀(guān)測(cè)了在有G蛋白和不同濃度GDP存在時(shí)μO(píng)R在激活狀態(tài)和抑制狀態(tài)之間的變化(圖4)。數(shù)據(jù)分析顯示,結(jié)合G蛋白時(shí),μO(píng)R存在兩個(gè)激活狀態(tài),分別對(duì)應(yīng)了兩種G蛋白的狀態(tài):結(jié)合GDP的G蛋白(EFRET=0.6)和不結(jié)合GDP的G蛋白(EFRET=0.5)。與低效能的配體相比,高效能配體增加了結(jié)合不含GDP的G蛋白的μO(píng)R比例,即更容易使G蛋白的GDP釋放從而結(jié)合GTP,進(jìn)而激活G蛋白。此外,高效能配體能促使μO(píng)R快速地結(jié)合G蛋白,并且增加G蛋白結(jié)合的穩(wěn)定性從而增加GTP結(jié)合的概率。

圖4.smFRET揭示的μO(píng)R的構(gòu)象變化

該研究不僅提高了科研界對(duì)μO(píng)R激活機(jī)制的理解,也為開(kāi)發(fā)新型的、副作用更小的鎮(zhèn)痛藥物提供了理論基礎(chǔ)。隨著對(duì)GPCR動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu)和功能之間關(guān)系的進(jìn)一步探索,未來(lái)有望開(kāi)發(fā)出更為安全有效的治療方案,以更好地應(yīng)對(duì)疼痛和其他相關(guān)疾病。

清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院副教授陳春來(lái)、斯坦福大學(xué)教授布賴(lài)恩·科比爾卡(Brian Kobilka和加州大學(xué)洛杉磯分校博士后馬蒂亞斯·埃爾蓋蒂(Matthias Elgeti,現(xiàn)為萊比錫大學(xué)醫(yī)學(xué)院研究員)為論文共同通訊作者;清華大學(xué)生命學(xué)院清華-北大生命科學(xué)聯(lián)合中心2013級(jí)博士生、醫(yī)學(xué)院原博士后趙佳偉(現(xiàn)為哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院博士后)與馬蒂亞斯·埃爾蓋蒂為論文共同第一作者。清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院博士后衡杰和基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院博士孫曉鷗參與了研究。研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金委、北京生物結(jié)構(gòu)前沿研究中心、北京結(jié)構(gòu)生物學(xué)高精尖創(chuàng)新中心、膜生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室以及清華-北大生命科學(xué)聯(lián)合中心的支持。

論文鏈接:

https://www.nature.com/articles/s41586-024-07295-2

供稿:生命學(xué)院

題圖設(shè)計(jì):韓羽臻

編輯:李華山

審核:郭玲

2024年04月19日 08:45:09

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