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清華大學(xué)舉辦PHENIX應(yīng)用國(guó)際研討會(huì)


  清華新聞網(wǎng)5月17日電  由清華大學(xué)結(jié)構(gòu)生物學(xué)高精尖創(chuàng)新中心主辦的為期兩天的蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)精修軟件PHENIX應(yīng)用國(guó)際研討會(huì)于5月10日結(jié)束。

受邀進(jìn)行報(bào)告的外籍教授。

  本次會(huì)議邀請(qǐng)了美國(guó)勞倫斯伯克利國(guó)家實(shí)驗(yàn)室的Pavel Afonine博士、Paul Adams博士、Nigel Moriarty博士、美國(guó)洛斯阿拉莫斯國(guó)家實(shí)驗(yàn)室的Tom Terwilliger博士以及英國(guó)劍橋大學(xué)的Randy Read 教授做主題報(bào)告,會(huì)議還邀請(qǐng)了清華大學(xué)副校長(zhǎng)、結(jié)構(gòu)生物學(xué)家施一公教授致辭。

施一公致辭。

  5月9日上午研討會(huì)開(kāi)幕,施一公為開(kāi)幕式致辭,他表示本次會(huì)議對(duì)促進(jìn)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的深入研究和軟件實(shí)踐應(yīng)用有著重要意義。

  五位外籍教授就研討主題分別做了報(bào)告。PHENIX是一個(gè)用X-射線(xiàn)晶體學(xué)解析生物大分子三維結(jié)構(gòu)的軟件,五位教授圍繞PHENIX軟件的設(shè)計(jì)特點(diǎn)、實(shí)驗(yàn)過(guò)程中的建模問(wèn)題、數(shù)據(jù)分析、新方法研究等內(nèi)容展開(kāi)探討。Paul Adams博士指出目前分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)中存在大量不理想或是不準(zhǔn)確的結(jié)構(gòu)解析,還進(jìn)一步提出在解析過(guò)程中如何避免一些隨機(jī)性、系統(tǒng)性錯(cuò)誤等問(wèn)題。Tom Terwilliger博士深入講解了如何設(shè)計(jì)SAD(single wavelength anomalous diffraction)以及如何進(jìn)行結(jié)果分析。他還強(qiáng)調(diào)了在分析圖表時(shí)需要注意的問(wèn)題,并分享了如何建立模型。Randy Read教授介紹了一種解決晶體學(xué)中相位問(wèn)題的新方法,即分子置換法。該方法可以有效的對(duì)未知結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)進(jìn)行解析。Nigel Moriarty博士圍繞在結(jié)構(gòu)精修中如何對(duì)新配位體提出合理的立體化學(xué)限制等問(wèn)題展開(kāi)討論。Pavel Afonine博士介紹了生物大分子的單晶結(jié)構(gòu)解析現(xiàn)狀和低溫冷凍電鏡蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的解析與精修。

教授們正與學(xué)生交流。

  10日,教授與學(xué)生密切交流,教授手把手的講解如何使用PHENIX軟件,并積極主動(dòng)的到學(xué)生中間進(jìn)行指導(dǎo)和交流。

供稿:結(jié)構(gòu)生物學(xué)高精尖創(chuàng)新中心  編輯:常 松

2016年05月17日 10:26:02

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