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生命學(xué)院朱聽(tīng)課題組實(shí)現(xiàn)不依賴(lài)氨酰tRNA合成酶的蛋白質(zhì)翻譯

清華新聞網(wǎng)3月15日電 構(gòu)成生命最基本的生物大分子核酸和蛋白質(zhì)具有手性均一性特征,即已知的天然核酸均由D型核糖組成,天然蛋白質(zhì)幾乎均由L型氨基酸組成。朱聽(tīng)課題組希望從鏡像中心法則出發(fā),利用化學(xué)、生物學(xué)等多學(xué)科手段構(gòu)建由L型核酸和D型蛋白質(zhì)組成的鏡像生物學(xué)系統(tǒng)。到目前為止,已初步實(shí)現(xiàn)了鏡像中心法則中的鏡像核酸復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、反轉(zhuǎn)錄等步驟,及鏡像PCR、鏡像核酸測(cè)序、鏡像核糖核蛋白復(fù)合體組裝等方法,并正在著力構(gòu)建鏡像蛋白質(zhì)翻譯系統(tǒng)以實(shí)現(xiàn)完整的鏡像中心法則。

對(duì)tRNA進(jìn)行氨基酸裝載是蛋白質(zhì)翻譯過(guò)程的一個(gè)重要步驟。自然界中的tRNA氨基酸裝載需要依賴(lài)一整套由數(shù)十種氨酰tRNA合成酶組成的復(fù)雜系統(tǒng)來(lái)完成。由于天然手性的氨酰tRNA合成酶無(wú)法識(shí)別并催化鏡像tRNA氨基酸裝載,而化學(xué)合成所有鏡像版本的氨酰tRNA合成酶存在很大難度,因此如何找到一種適用于鏡像tRNA氨基酸裝載的方法是實(shí)現(xiàn)鏡像蛋白質(zhì)翻譯必須解決的難題之一。雖然可對(duì)tRNA進(jìn)行氨基酸裝載的核酶Flexizyme早在2006年就已被發(fā)現(xiàn),但由于翻譯效率很低,不依賴(lài)氨酰tRNA合成酶的蛋白質(zhì)翻譯一直未被實(shí)現(xiàn)。同時(shí),由于傳統(tǒng)RNA化學(xué)合成技術(shù)的限制,全長(zhǎng)鏡像tRNA的合成效率與純度都不高,無(wú)法被用于鏡像氨基酸裝載。

在該研究中,清華大學(xué)生命學(xué)院朱聽(tīng)課題組在天然手性模型中對(duì)使用Flexizyme進(jìn)行tRNA氨基酸裝載的蛋白質(zhì)翻譯系統(tǒng)做了重新設(shè)計(jì)與優(yōu)化,首次實(shí)現(xiàn)了不依賴(lài)氨酰tRNA合成酶的蛋白質(zhì)翻譯并得到多種具有活性的酶(圖1)。值得一提的是,在沒(méi)有氨酰tRNA合成酶的參與下,該系統(tǒng)翻譯產(chǎn)生了具有活性的氨酰tRNA合成酶TrpRS,顯示在生命起源過(guò)程中,類(lèi)似具有tRNA氨基酸裝載功能的核酶可能在蛋白質(zhì)翻譯系統(tǒng)的早期進(jìn)化中發(fā)揮了重要作用。

圖1 不依賴(lài)氨酰tRNA合成酶的蛋白質(zhì)翻譯

在相應(yīng)的鏡像系統(tǒng)中,課題組利用優(yōu)化后的鏡像核酸轉(zhuǎn)錄方法成功制備出高純度的全長(zhǎng)鏡像tRNA,并使用合成的鏡像Flexizyme將鏡像氨基酸裝載到相應(yīng)的鏡像tRNA上(圖2),為將來(lái)實(shí)現(xiàn)鏡像蛋白質(zhì)翻譯奠定了方法學(xué)基礎(chǔ)。

圖2 使用鏡像Flexizyme將鏡像氨基酸裝載到鏡像tRNA上

3月11日,清華大學(xué)生命學(xué)院朱聽(tīng)課題組在《化學(xué)》(Chem)期刊發(fā)表了題為“不依賴(lài)氨酰tRNA合成酶的蛋白質(zhì)翻譯”(Translating protein enzymes without aminoacyl-tRNA synthetases)的研究論文,報(bào)道實(shí)現(xiàn)不依賴(lài)氨酰tRNA合成酶的蛋白質(zhì)翻譯,并嘗試對(duì)鏡像tRNA進(jìn)行氨基酸裝載。

清華大學(xué)生命學(xué)院博士后、結(jié)構(gòu)生物學(xué)高精尖創(chuàng)新中心卓越學(xué)者陳季博士為論文第一作者,生命學(xué)院朱聽(tīng)教授為通訊作者。清華-北大生命科學(xué)聯(lián)合中心博士生陳夢(mèng)茵為該研究作出了重要貢獻(xiàn)。該研究獲得了國(guó)家自然科學(xué)基金委、清華-北大生命科學(xué)聯(lián)合中心、清華大學(xué)結(jié)構(gòu)生物學(xué)高精尖創(chuàng)新中心和北京生物結(jié)構(gòu)前沿研究中心的資助。

論文鏈接:

https://www.cell.com/chem/fulltext/S2451-9294(21)00046-2

供稿:生命學(xué)院

編輯:韓瑞瑞 陳曉艷

審核:李晨暉

2021年03月15日 09:21:16

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